成都中医药大学附属医院是国家中医临床（糖尿病）研究基地和国家药物临床试验机构（GCP），建有“中医内分泌代谢疾病”和“中医心脑血管疾病”两个省级临床医学研究中心。创建我国第一个省级中医药循证平台“四川省中医药循证医学中心”。 拥有三级科研实验室1个，二级实验室3个，财政部中央与地方共建实验室2个，四川省重点实验室1个，省级科普基地1个。
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